研究表明，实验鲫鱼饲料的蛋白源组成也会影响鱼类对某种必需氨基酸的需求量，多数鱼类对蛋白氨基酸的利用率要优于晶体氨基酸。由于植物性蛋白源往往缺乏鱼类生长所必需的某一种或某几种必需氨基酸，故以植物性蛋白作为实验饲料的主要蛋白源时，得出的氨基酸需求量往往高于以动物性蛋白作为实验饲料主要蛋白源时的需求量；此外，精制饲料中使用酪蛋白和明胶作为主要蛋白源，这将会导致鱼类的摄食率降低，并进一步影响鱼体对必需氨基酸的需求量。
饲料必需氨基酸的添加形式
一般情况下，鱼类对饲料原料中的蛋白氨基酸和外源添加的游离晶体氨基酸吸收不同步。例如，有研究认为鱼体对饲料中蛋白结合Lys的利用率要高于晶体Lys。饲料中添加晶体氨基酸可能会影响其他种必需氨基酸的吸收，还会导致氨基酸分解代谢过多；另外，饲料在水中浸泡极易导致添加的晶体氨基酸溶解流失，这些因素都会导致鱼体对必需氨基酸需求量的研究结果过高。
添加包膜氨基酸可以改善鱼类对晶体氨基酸利用率较低的现象。当以包膜氨基酸形式添加时，氨基酸在水中的溶出率降低，同时鱼体对氨基酸的利用效率显著提高。在饲料中补充包膜Lys与不补充或补充晶体Lys相比，草鱼的生长、饲料效率和蛋白质合成率等都得到改善。此外，分别添加晶体Lys和包膜Lys制成颗粒饲料，然后分别取一定量用于Lys溶出率的测定，结果表明，晶体氨基酸饲料组Lys溶出率约为13.22%，而包膜氨基酸饲料组Lys溶出率约为4.81%，显著低于前者。
因此，必需氨基酸的添加形式也会影响鱼类对其需求量的研究。当以晶体氨基酸形式添加时，鱼类对必需氨基酸的需要量要高于以包膜氨基酸形式添加时的需要量。