沈阳牛羊饲料在发酵的过程中，微生物区系平衡被打破后，益生菌在特定情况下有可能会转变为病原菌，如乳酸杆菌引起的临床感染。因此发酵饲料的使用应充分考虑动物、消费者以及环境等因素方面的问题，经过严格的科学试验确认其无害后才能推广应用。微生物发酵饲料中的大部分有益菌是活菌，而抗生素具有杀菌作用，因此二者也不能同时使用。 

沈阳牛羊饲料由于各种微生物饲料的菌种组合以及饲喂方法的不同，要针对不同的动物选用不同种类的微生物发酵饲料，养殖企业在选择微生物发酵饲料时应充分考虑动物种类，生理阶段，饲养条件和使用目的等因素，来确保每类产品都有明确的使用对象。

沈阳牛羊饲料菌种的搭配尤为关键，微生物发酵饲料作为一种新型饲料添加剂，来源广泛，资源丰富，通过微生物发酵工艺将农业废弃物转化为有用的产品，有效的降低环境污染，解决人畜争粮问题，微生物发酵饲料市场前景广阔，近年来应用科学，发酵工程等相关学科的飞速发展，为微生物发酵饲料的发展提供了良好的理论基础。换言之，微生物发酵饲料在将来的推广应用会越来越科学化，普遍化，会为广大养殖者们带来理想的经济效益，使用微生物发酵饲料会是养殖行业的发展趋势。

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